Теперь, если Вы владеете долей в ООО (ОДО, КФХ или хозяйственном товариществе) более трёх лет непрерывно (начиная с 01.01.2014 года), то при её продаже не придется уплачивать подоходный налог - независимо от того, за какую сумму Вы её продали (в т.ч. и за сумму, значительно превышающую сумму Вашего вклада в уставный фонд).
Подробный материал об этом читайте здесь: С 01 января 2017 г. не облагаются подоходным налогом доходы от продажи доли в уставном фонде, принадлежащей продавцу более 3-х лет.